La División de Biología Experimental y Aplicada se fundó para ampliar el espectro de investigaciones biológicas en el CICESE. Sus cuatro departamentos: Biología de la Conservación, Biotecnología Marina, Innovación Biomédica y Microbiología cubren áreas de gran interés científico y gran potencial para atender las necesidades económicas y los retos ecológicos de la región, para buscar y explorar terrenos novedosos en la investigación biológica moderna y para entrenar, a nivel de maestría y doctorado, a los futuros investigadores del país en estas áreas.