A través de los análisis metagenómicos se han realizado avances científicos y médicos que permiten entender los papeles tan diversos que juegan los microorganismos en los ambientes marinos y costeros, y en enfermedades como la obesidad y la diabetes. La metagenómica persigue obtener secuencias del genoma de los diferentes microorganismos que componen una comunidad, extrayendo y analizando su ADN de forma global. Los análisis genómicos hoy en día han permitido entender la diversidad de los organismos, y a su vez obtener beneficios de este conocimiento en áreas como la medicina, acuicultura, agricultura y otros sectores, al poder entender el funcionamiento de virus y bacterias y su interacción, señaló la Dra. Clara Galindo Sánchez, investigadora del Departamento de Biotecnología Marina y coordinadora del III Taller de Análisis de Secuencias Genómicas y Metagenómicas que se realizó el 23 y 24 de septiembre en instalaciones del CICESE. Por la gran cantidad de datos a interpretar, esta metodología es aplicable a varias disciplinas, y hay proyectos que tienen beneficios industriales, como la identificación genómica de cepas de virus y bacterias que afectan a organismos acuáticos de interés comercial, como el camarón. “Otro aspecto de interés es el estudio de la flora bacteriana humana, en la que previamente teníamos que analizar gen por gen, cuando ahora podemos hacer todo un análisis completo para entender las comunidades microbianas en el intestino y cómo se relacionan con la prevalencia de enfermedades como la diabetes o la obesidad”, agregó el Dr. Bruno González Gil, investigador del CIAD Unidad Mazatlán. Es en ese contexto, es fundamental para los científicos mexicanos mantenerse actualizados respecto a los métodos bioinformáticos que se utilizan para analizar las secuencias, y con ese fin se instrumentó una serie de talleres de actualización dirigida a investigadores y estudiantes de posgrado, otorgando becas gracias al apoyo del CICESE, dijo a su vez Galindo Sánchez. El primer taller fue realizado en el CIAD, Mazatlán, y el segundo en el CIBNOR, La Paz, lo cual habla del esfuerzo interinstitucional por fortalecer esta área de la investigación. En este tercer taller participaron como instructores investigadores del CICESE, CIAD Unidad Mazatlán, y la Universidad de California en San Diego, así como estudiantes de posgrados, técnicos e investigadores de varias instituciones académicas del país, principalmente del noroeste . Investigadores y estudiantes de posgrado de más de 13 instituciones académicas participaron en el taller, entre las que se cuentan CICESE, UABC, CIBNOR, UABCS, UAS, CIAD, UNAM, Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN), Centro de Biotecnología Genómica (IPN), University of Connecticut, Instituto de Investigaciones Agropecuarias y Forestales (IIAF), UNISON e ITSON. “Este taller es importante para nosotros porque logramos conjuntar a investigadores no sólo de otros departamentos del CICESE, sino de varias instituciones, con el fin de que podamos fomentar nuestra colaboración científica”, dijo la doctora Galindo Sánchez. Durante el taller se realizaron presentaciones sobre temas como comparación de genomas, ensamble de lecturas y calidad del ensamble y anotación de contigs, así como de metagenómica funcional y estadística.